Στα βυζαντινά χρόνια αποκαλούνταν “Ιερά Μονή της Ακαταμάχητου Θεοτόκου των Μεγάλων Πυλών”, την οποία οικοδόμησε η βυζαντινή οικογένεια των Αγγέλων Δούκα Κομνηνών του Δεσποτάτου της Ηπείρου.Ο Ναός είναι χτισμένος στα ερείπια αρχαίου ναού που ήταν αφιερωμένος στη θεά Αθηνά.
